Antecedentes/Objetivos: Los objetivos de este estudio son definir los roles de los genes del receptor tirosina quinasa neurotrófico NTRK1, NTRK2 y NTRK3 (NTRK1/2/3) en el CRC y determinar las significaciones clínico-patológicas, moleculares, de señalización de cáncer y potencialmente predictivas de la expresión de NTRK1/2/3 en el CRC, independientemente de la fusión del gen NTRK. Métodos: Se utilizaron pruebas estadísticas estándar en SPSS para interrogar las asociaciones y correlaciones entre la expresión de NTRK1/2/3 y las características clínico-patológicas, moleculares y genómicas en dos cohortes de CRC. También se investigó la desregulación de la expresión de NTRK1/2/3 utilizando análisis de correlación y regresión.
Además, se utilizaron el análisis de riqueza de conjuntos de genes (GSEA) y el análisis de riqueza de ontologías de vías/drogas (POEA/DOEA) para interrogar la riqueza de las vías de señalización del cáncer, así como la respuesta a inhibidores de tirosina quinasa NTRK y otros en las cohortes de CRC. Resultados: Mientras que la expresión de NTRK1 fue mayor en el subconjunto de CRC con inestabilidad microsatelital, la expresión de NTRK2/3 se sobreexpresó preferentemente en los subconjuntos estables de microsatélites.
Además, hubo una expresión diferencial de NTRK1/2/3 con respecto a las características clínico-patológicas e indicadores moleculares/genómicos. Asimismo, este estudio demostró que la expresión de NTRK1/2/3 fue desregulada por combinaciones de alteraciones en el número de copias (NTRK2), metilación aberrante (NTRK1/2/3) y potencialmente fusión génica criptográfica (NTRK3).
Además, GSEA y POEA demostraron que los subconjuntos CRC con alta expresión de NTRK1/2/3 exhibieron riqueza en las vías de señalización del NTRK, así como en las conocidas vías de señalización del cáncer.
El GSEA y DOEA mostraron que la señalización del NTRK estaba rica en respuestas a inhibidores de quinasas, representando evidencia de que la expresión de NTRK1/2/3 puede servir como biomarcadores para múltiples inhibidores de quinasa, incluyendo entrectinib-el inhibidor de quinasa agnóstico del tejido para cánceres con fusión génica NTRK. Conclusiones: Los resultados demostraron que la señalización fusion-negativa NTRK puede estar activa en el CRC y puede contribuir a la patogenia molecular y biología de la enfermedad.
Además, los resultados también demostraron que la expresión de NTRK1/2/3 puede ser predictiva para múltiples inhibidores de quinasas.
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