El cáncer colorrectal (CRC) es un tumor maligno común a nivel mundial. La vía de síntesis de colesterol (CS) es crucial en la ocurrencia y desarrollo del cáncer.
Este estudio tiene como objetivo predecir el pronóstico de los pacientes con CRC basándose en los genes relacionados con la síntesis de colesterol (CSRGs). Los datos de los pacientes con CRC fueron descargados de las bases de datos TCGA y GEO, y los CSRGs se descargaron de Genecards. En el conjunto de entrenamiento TCGA-CRC, se realizó un análisis de regresión de Cox univariado en los CSRGs y se llevó a cabo una clasificación por subtipos mediante agrupamiento por consenso. Con la combinación de la red PPI y el análisis de regresión, se identificaron los CSRG clave para establecer un modelo pronóstico.
Se utilizaron curvas ROC y el análisis de supervivencia de Kaplan-Meier para evaluar y validar el modelo en el conjunto de validación GSE17538. Al mismo tiempo, se realizó un análisis inmunológico y un análisis de sensibilidad a los medicamentos. Finalmente, se investigaron las funciones de estos genes característicos en un modelo celular in vitro. El TCGA-CRC se dividió en dos subtipos.
Se construyó una firma de riesgo relacionada con la síntesis de colesterol (CSRS) compuesta por 10 genes. Los pacientes fueron agrupados según el valor mediano de la CSRS. El grupo de alto-CSRS tuvo un pronóstico más pobre y en este grupo era mayor la abundancia de macrófagos, neutrófilos y TIL. La predicción de sensibilidad a los medicamentos indicó que varios medicamentos candidatos (como Linsitinib) podrían afectar el curso del CRC mediante mecanismos únicos.
Los experimentos in vitro demostraron que EEF1A2 podría promover la progresión maligna de los tumores.
Los resultados de este proyecto proporcionan algunas pautas para elucidar potenciales biomarcadores relacionados con CS para predecir el pronóstico en pacientes con CRC.
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