La composición de lípidos en la membrana cambia concurrentemente con la diferenciación de los colonocitos humanos, un proceso altamente regulado que ocurre a lo largo del criptón del colon. Este proceso está fuertemente perturbado en el cáncer colorrectal.
Sin embargo, los mecanismos regulatorios que impulsan estos cambios, especialmente la sustitución de las especies fosfatidilinositol de ácido araquidónico con especies de ácidos grasos monoinsaturados, y cómo se alteran en el cáncer, permanecen desconocidos. Para establecer las redes trascripcionales subyacentes a este remodelado, integramos los perfiles transcriptómicos y lipídicos de colonocitos humanos sanos e tumorales aislados utilizando enfoques de biología sistemática; identificando redes clave de regulación génica involucradas en el metabolismo del ácido araquidónico y eicosanoide y del ciclo fosfatidilinositol como reguladores significativos durante la diferenciación. Consistentemente, se encontró un impacto distinto en la diferenciación de organoides dependiendo del subtipo de colonocito y prostaglandina específica. Sorprendentemente, el cambio y los programas transcriptómicos asociados se perdieron en el tumor que intensificaba el metabolismo de fosfoinositidios.
En conjunto, estos resultados subrayan la importancia del remodelado lipídico en la mantención de la stemness de los colonocitos y el inicio adecuado de los programas de diferenciación.
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