Detección de Clostridioides difficile en una cohorte humana de CCR

Antecedentes: El papel del microbioma intestinal y bacterias entericas específicas en la influencia del desarrollo de cáncer colorrectal (CRC) sigue siendo incompletamente comprendido. Recientemente se demostró que cepas humanas derivadas de CRC de Clostridioides difficile eran capaces de inducir tumorigénesis colónica en un modelo de ratón susceptible.

Hipotetizamos que C. difficile contribuye a la patogenia del CRC humano y estaría enriquecido en tumores de CRC comparado con tejidos normales emparejados del mismo individuo. Métodos: Analizamos muestras de tejido tumor/normal emparejadas de una cohorte de 108 individuos que se presentaron a un hospital terciario en Kuala Lumpur, Malasia para resección de CRC entre 2013-2014.

Evaluamos la prevalencia de la detección de C. difficile utilizando secuenciación de ampicónes de ARNr 16S con asignación taxonómica de alta resolución así como cultivo y PCR. Resultados: Encontramos que la detección de C. difficile era prevalente (38% de individuos), pero de baja abundancia (mediana relativa de abundancia en tumor del 0,01%, tejido normal emparejado del 0,006% [p=0,4]). La detección de C. difficile fue más prevalente en individuos con tejidos tumorales biofilm-positivos que biofilm-negativos (es decir, el 81% de los individuos positivos para C. difficile eran biofilm-positivos vs. el 63% de los individuos negativos para C. difficile [p=0,04]).

Además, en análisis exploratorios, describimos patrones de diferencias taxonómicas y funcionales inferidas entre grupos positivos y negativos para C. difficile. Conclusión: Estos hallazgos sugieren que C. difficile está presente con frecuencia en baja abundancia en el microbioma tumoral con un posible impacto significativo en la composición comunitaria y función.