El análisis integrado de la transcriptómica unicelular y espacial revela el microambiente del cáncer colorrectal.

El cáncer colorrectal (CCR) es una neoplasia con una alta incidencia y tasas de mortalidad a nivel mundial, lo que hace necesario el desarrollo de enfoques innovadores para comprender sus características biológicas y su comportamiento clínico. La integración del secuenciamiento de células individuales y la transcriptómica espacial ha surgido como una herramienta revolucionaria en la investigación del CCR. El secuenciamiento de células individuales revela la heterogeneidad tumoral y las redes de interacción, mientras que la transcriptómica espacial mapea con precisión la distribución celular y la arquitectura tisular dentro del microambiente tumoral (MET). Este enfoque integrado ha revelado redes tumor-estroma-inmune organizadas espacialmente, que incluyen zonas de exclusión inmune caracterizadas por barreras de la MEC mediadas por CAF y TAMs SPP1+, nichos inmunoactivos que presentan cooperación entre células T y células mieloides, y dominios asociados a TLS con microambientes tanto activadores como supresores.

Los descubrimientos clave incluyen células epiteliales con alta expresión de MGP que impulsan la metástasis hepática a través de la regulación al alza de PD-L1 mediada por NF-κB, CAF SPP1+ que forman nichos metastásicos inmunosupresores y mecanismos funcionalmente validados, como los iCAF IL1R1+ que inducen la polarización M2 y las interacciones MDK-SDC4 que promueven la migración de células Treg.

Estos hallazgos identifican posibles biomarcadores (por ejemplo, TIMP1, CAF SPP1+) y posibles dianas terapéuticas (por ejemplo, iCAF IL1R1+, eje MDK-SDC4) con relevancia clínica. Esta revisión resume los avances recientes en la aplicación de estas tecnologías integradas para la investigación del CCR, analiza sus perspectivas y desafíos en la caracterización de tumores y el avance de diagnósticos y terapias de precisión, y presenta un marco teórico para guiar la investigación futura y la práctica clínica en el estudio y tratamiento del CCR.