Análisis computacional guiado por la estructura de los efectos de enlace en un scFv dirigido a la guanilil ciclasa C

Los fragmentos variables de cadena única (scFvs) se utilizan ampliamente en aplicaciones diagnósticas y terapéuticas. Estos fragmentos de anticuerpos constan de dos dominios variables conectados por un enlazador peptídico flexible cuyas propiedades influyen decisivamente en el plegamiento, la estabilidad, el estado oligomérico y la unión al antígeno.

Por lo tanto, la selección cuidadosa del enlazador representa un paso clave en el diseño de scFv. La guanilil ciclasa C (GUCY2C) es un receptor de superficie celular asociado a tumores que se expresa en neoplasias gastrointestinales, entre ellas más del 90% de los casos de cáncer colorrectal (CCR) en todas las fases de la enfermedad. Su patrón de expresión fisiológica restringida convierte a GUCY2C en una diana atractiva para la inmunoterapia y las terapias oncológicas de precisión. En este trabajo investigamos las consecuencias estructurales y funcionales de la incorporación de diseños alternativos de enlazador en un scFv anti-GUCY2C.

Mediante modelado molecular, acoplamiento proteína-proteína y simulaciones de dinámica molecular (MD), evaluamos la estabilidad conformacional, la organización entre dominios y las interacciones de unión a antígeno de cada constructo.

Nuestros resultados proporcionan una evaluación dinámica, basada en la estructura, de cómo la composición del enlazador influye en el reconocimiento de GUCY2C y en el comportamiento estructural del scFv.

Además, este trabajo establece un marco computacional para la optimización racional de fragmentos de anticuerpos dirigidos a GUCY2C.