Valor pronóstico de FUBP1 en el cáncer colorrectal y asociación con las características del microambiente inmunitario.

Para investigar la expresión de FUBP1, su valor pronóstico, el impacto en el microambiente tumoral (TME) y la sensibilidad a los fármacos en el cáncer colorrectal (CRC), y para explorar sus posibles mecanismos subyacentes. Utilizando datos de The Cancer Genome Atlas (TCGA), analizamos la expresión de FUBP1 en CRC, evaluamos su valor pronóstico mediante análisis de supervivencia y la construcción de un nomograma, realizamos un análisis de enriquecimiento de vías y evaluamos la infiltración de células inmunitarias y la estimación de células estromales e inmunitarias en tejidos tumorales malignos utilizando las puntuaciones de ESTIMATE.

Además, realizamos una validación mediante inmunohistoquímica (IHC) en una cohorte institucional independiente y analizamos el conjunto de datos de secuenciación de ARN de una sola célula del Gene Expression Omnibus (GEO) GSE132465 (n = 63.689 células) para examinar la asociación entre la expresión de FUBP1 y el microambiente inmunitario tumoral a nivel de una sola célula. Se encontró que FUBP1 se expresaba en gran medida en CRC (P < 0,001), particularmente en pacientes más jóvenes. La alta expresión de FUBP1 se asoció con una mejora de la supervivencia general en el análisis univariado (HR = 0,68, P = 0,028), pero esta asociación no se mantuvo como un factor pronóstico independiente después del ajuste por otras covariables clínicas (HR = 0,722, P = 0,098).

Los resultados de la inmunohistoquímica de la cohorte independiente confirmaron la sobreexpresión de la proteína FUBP1 en el 90% de las muestras de CRC. El análisis de una sola célula reveló que los grupos de células con alta expresión de FUBP1 presentaban una reducción notable en la infiltración de células inmunitarias (35,97% frente a 62,96%, P < 0,001), lo que indica un microambiente tumoral "frío" inmunosupresor. Los tumores con alta expresión de FUBP1 también mostraron una mayor expresión de PD-L1, PD-1 y CTLA4, valores más bajos de concentración inhibitoria media (IC50) para oxaliplatino, irinotecán y 5-fluorouracilo, y una puntuación de fenotipo inmunitario (IPS) más alta para la monoterapia anti-PD-1 o la inmunoterapia combinada anti-CTLA-4. La expresión de FUBP1 se correlacionó con un aumento en la expresión de MYC, TP53 y sus genes diana posteriores (CCND1, CDK4, BAX, CDKN1A).

FUBP1 se expresa en gran medida en CRC y se asocia con un microambiente tumoral "frío" inmunosupresor caracterizado por una disminución de la infiltración de células inmunitarias, al tiempo que se correlaciona con una sensibilidad favorable a la quimioterapia. FUBP1 puede servir como un posible biomarcador predictivo para las respuestas a la quimioterapia y la inmunoterapia, en lugar de un indicador pronóstico independiente para la supervivencia. Su relación con las vías de señalización de MYC y TP53 justifica una mayor investigación mecanicista.