El microbioma intestinal ha surgido como un factor clave en la biología del cáncer. Estudios previos se han centrado en tipos de cáncer individuales y, a menudo, no tienen en cuenta las comorbilidades, lo que dificulta determinar si las asociaciones observadas son específicas de un tipo de cáncer. Aquí, presentamos los resultados de un estudio en un entorno real con una cohorte de pacientes con diferentes tipos de cáncer (Mayo Clinic Cancer Microbiome), que comprende 1.364 pacientes con cáncer y 287 controles sanos. Al aplicar un marco de trabajo para tener en cuenta las asociaciones no específicas del microbioma con el cáncer, las comorbilidades y las variables demográficas y clínicas, identificamos 341 especies asociadas al cáncer en cinco clases de cáncer, que representan los contribuyentes más plausibles a la patogénesis del cáncer.
Dentro de las clases de cáncer, encontramos niveles más bajos de ácidos biliares fecales y C. scindens en el cáncer de mama de inicio temprano, y niveles elevados de lactato y Veillonella parvula en el cáncer colorrectal de inicio temprano.
Además, Anaerostipes hadrus, que codifica la dihidropirimidina deshidrogenasa, resultó ser protectora contra la diarrea inducida por 5-fluorouracilo.
Estos hallazgos demuestran la solidez de nuestra cohorte y proporcionan un recurso fundamental para el descubrimiento de firmas del microbioma específicas del cáncer y biomarcadores predictivos.
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