Caracterización molecular de las metástasis hepáticas del cáncer colorrectal con patrones de crecimiento histopatológico puramente desmoplásico frente a no puramente desmoplásicos, utilizando un panel de expresión génica dirigido.

El patrón de crecimiento histológico (HGP) en la interfaz de las metástasis hepáticas del adenocarcinoma colorrectal (CRCLM) y el parénquima hepático proporciona información pronóstica importante.

Este estudio tuvo como objetivo identificar las firmas transcripómicas subyacentes a los HGP predominantes en CRCLM. Evaluamos retrospectivamente el HGP de 495 CRCLM de 232 pacientes sometidos a metástectomía en el Hospital Universitario de Regensburg entre 2003 y 2016. Se analizó un subconjunto representativo de 106 metástasis de 53 pacientes para determinar la expresión de ARN en la interfaz metástasis-hígado utilizando el panel NanoString nCounter® PanCancer Progression. Los HGP más comunes en el subgrupo NanoString fueron el tipo infiltrativo de reemplazo (rHGP, 47,2%) y el tipo no infiltrativo desmoplásico (dHGP, 46,3%).

El análisis de agrupamiento no supervisado de los perfiles de expresión génica de CRCLM identificó cuatro grupos de genes, dos de los cuales estaban significativamente enriquecidos con dHGP puro o rHGP puro. El análisis de expresión diferencial entre dHGP puro y todos los demás HGP (es decir, dHGP no puro) identificó 55 genes con una expresión significativamente diferente. El análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes corroboró las señales previamente informadas (organización de la matriz extracelular, conjuntos de genes estromales/endoteliales y enriquecimiento de la transición epitelio-mesenquimal en dHGP puro; metabolismo de la glucosa en dHGP no puro) y reveló además la señalización de la integrina α6β4 como característica del dHGP no puro. La identidad del paciente, más que el HGP, fue el principal factor determinante de la varianza de la expresión génica, aunque AGR2 se sobreexpresó de forma consistente y significativa en el dHGP no puro en diferentes estrategias analíticas.

Estos hallazgos corroboran las diferencias transcripómicas conocidas entre los HGP, identifican la señalización de la integrina α6β4 como una vía candidata adicional enriquecida en CRCLM con dHGP no puro y subrayan la importante contribución de los factores específicos del paciente a la variabilidad de la expresión génica en CRCLM, superando al HGP.