El cáncer colorrectal (CCR) es heterogéneo, pero las clasificaciones actuales solo capturan esta heterogeneidad en parte. Aquí presentamos un recurso multimodal de 1.000 casos de CCR que no han recibido tratamiento previo, el grupo de CCR con el perfil proteómico más amplio hasta la fecha, que integra proteómica profunda, genómica dirigida, histopatología de toda la lámina y seguimiento clínico. A partir del proteoma, derivamos seis subgrupos que reproducen las clases MSI y mesenquimal, resolvemos la clase cromosómicamente inestable en tres subgrupos funcionales, incluido un subgrupo indolente con un resultado favorable, e identificamos un subgrupo raro y previamente no reconocido con un resultado desfavorable. Los subgrupos están asociados con el curso clínico, la supervivencia asociada a la quimioterapia, las mutaciones impulsoras y la respuesta farmacológica prevista.
Dado que están definidos por programas multiprotéicos coordinados, su asignación requiere una clasificación multiprotéica en lugar de marcadores únicos y se puede aplicar a una cohorte independiente. La colección de imágenes de toda la lámina que se adjunta establece puntos de referencia para inferir los subgrupos proteómicos a partir de la morfología. Todos los datos se publican como una referencia abierta para la estratificación funcional del CCR y la patología computacional.
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