El cáncer colorrectal (CCR) sigue siendo una de las principales causas de mortalidad relacionada con el cáncer, y los avances en inmunoterapia se ven obstaculizados por las respuestas subóptimas de los pacientes. La muerte celular inmunogénica (MCI), un proceso distinto que promueve la inmunidad antitumoral, ha atraído una atención considerable en la investigación oncológica.
Sin embargo, los modelos pronósticos basados en la MCI para el CCR siguen siendo insuficientemente investigados. El objetivo de este estudio fue analizar los genes relacionados con la MCI (ICDRG) en el CCR y desarrollar un marco pronóstico que mejore la comprensión de los mecanismos de la enfermedad para identificar posibles marcadores pronósticos. Se integraron datos de TCGA-CCR, GSE17536 y ICDRG para identificar los genes expresados diferencialmente (DEG) entre los tejidos tumorales y normales. Un análisis de redes de coexpresión génica ponderada (WGCNA) identificó los módulos asociados con la muerte celular inmunogénica (MCI) utilizando las puntuaciones de MCI derivadas de ssGSEA.
La intersección de los DEG y los genes del módulo formó el conjunto de candidatos. Se identificaron los determinantes pronósticos y los factores de riesgo para desarrollar los modelos de riesgo y pronóstico. Se realizaron análisis de enriquecimiento funcional en los grupos de riesgo para dilucidar las vías relacionadas con el CCR. Se evaluaron los patrones de infiltración inmune y los estados de MSI en TCGA-CCR.
Además, se comparó la sensibilidad a los fármacos entre los grupos de alto y bajo riesgo y entre los grupos MSI-H y MSI-L/MSS. Por último, se validó la expresión de los genes pronósticos en el CCR y los tejidos adyacentes no tumorales mediante qRT-PCR. La superposición entre 979 genes expresados diferencialmente (DEG) y 1217 genes modulares en TCGA-CCR identificó 47 genes candidatos. De este conjunto, cinco genes que se mantuvieron en la regresión de Cox multivariante, GPRASP1, FAT4, MEIS2, COMP y CXCL10, se incorporaron a un modelo de riesgo que mostró una precisión predictiva moderada en el grupo de validación GSE17536.
Posteriormente, se estableció un nomograma que integraba la puntuación de riesgo con la edad y las etapas T, N y M. Un análisis de la infiltración inmune reveló una asociación significativa entre la puntuación de riesgo y las células T reguladoras (Treg), mientras que CXCL10 exhibió una marcada correlación positiva con múltiples puntos de control inmunitarios. Las evaluaciones de la sensibilidad a los fármacos revelaron disparidades significativas en las respuestas a los agentes quimioterapéuticos estándar entre los grupos de alto y bajo riesgo, así como entre los grupos MSI-H y MSI-L/MSS.
Además, un análisis de qRT-PCR confirmó la sobreexpresión significativa de COMP y CXCL10 en los tejidos de CCR.
Este estudio identificó COMP y CXCL10 como genes pronósticos significativamente expresados en el cáncer colorrectal e introdujo un nuevo modelo pronóstico asociado con la muerte celular inmunitaria. El modelo exhibió una fiabilidad predictiva consistente tanto en los conjuntos de datos de entrenamiento como de validación, proporcionando información valiosa para la evaluación del pronóstico y las estrategias terapéuticas en el CCR.
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