El cáncer colorrectal (CCR) es un problema de salud pública importante, lo que destaca la necesidad crítica de identificar nuevos objetivos de intervención para su prevención. Realizamos análisis de interacción a nivel del genoma para 15 factores de exposición con riesgo establecido o putativo de CCR [índice de masa corporal (IMC), altura, actividad física, tabaquismo, diabetes tipo 2, uso de terapia hormonal para la menopausia, fármacos antiinflamatorios no esteroideos y consumo de alcohol, calcio, fibra, folato, frutas, carne procesada, carne roja y verduras], y utilizamos las estimaciones de interacción para explorar las vías y los genes subyacentes al riesgo de CCR. Se utilizaron la combinación adaptativa de factores de Bayes (ADABF) y el análisis de sobrerrepresentación (ORA) para los análisis de vías, y los resultados se investigaron más a fondo utilizando recursos disponibles públicamente [características distintivas del cáncer, Plataforma Open Targets (OTP)]. Un total de 1973 vías utilizando ADABF y 840 vías utilizando ORA, de las 2950 analizadas, se encontraron enriquecidas (P < 0,05) para al menos un factor de exposición, así como 1227 genes dentro de las vías enriquecidas.
Los datos estaban disponibles para 811/1227 genes codificantes en la OTP, de los cuales 241 contaban con un sólido respaldo de evidencia previa (puntuación general de la OTP > 0,05). El cincuenta por ciento de los genes (617/1227) se asignaron a al menos una característica distintiva del cáncer, y la mayoría de ellos (388/617) pertenecieron a la característica distintiva de la señalización proliferativa sostenida. Nuestros hallazgos reflejan las vías previamente establecidas para el riesgo de CCR y destacan la importancia emergente de varios genes menos estudiados. Se encontraron vías comunes para varias combinaciones de factores de exposición, lo que sugiere potencialmente mecanismos subyacentes comunes.
Los resultados del presente análisis proporcionan una base para una investigación funcional adicional. Si se confirman, podrían ayudar a dilucidar las asociaciones etiológicas entre los factores de riesgo y el riesgo de CCR e, en última instancia, a fundamentar estrategias de prevención personalizadas.
Este estudio fue financiado por Cancer Research UK (CRUK; número de subvención: PPRCPJT 100005) y World Cancer Research Fund International (WCRF; IIG_FULL_2020_022). La financiación para la subvención IIG_FULL_2020_022 se obtuvo de Wereld Kanker Onderzoek Fonds (WKOF) como parte del programa de subvenciones de World Cancer Research Fund International. Los detalles completos de la financiación para los consorcios individuales se proporcionan en los agradecimientos.
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