Un sistema de puntuación basado en el aprendizaje automático para identificar tumores con estabilidad de microsatélites y alta inmunoactividad mediante la cuantificación de la similitud con tumores con alta inestabilidad de microsatélites en cánceres colorrectales: desarrollo y estudio cuantitativo.

Los cánceres colorrectales (CCR) con estabilidad de microsatélites (MSS) presentan una respuesta limitada a los inhibidores de los puntos de control inmunitario (ICIs) en comparación con los CCR con alta inestabilidad de microsatélites (MSI-H). No obstante, estudios previos han demostrado que algunos CCR MSS son sensibles a los ICIs, aunque aún faltan criterios establecidos para justificar el tratamiento. El objetivo de este estudio fue analizar las características de los linfocitos infiltrantes tumorales (TIL) en los CCR MSS y desarrollar una nueva herramienta computacional para la predicción de la similitud entre el estado MSS y MSI-H en pacientes con CCR, basándose en múltiples factores. Recopilamos y analizamos datos de 188 pacientes con CCR, incluyendo el estado de MSI, la distribución de las células inmunitarias, las características clínicas y las mutaciones genéticas, utilizando métodos estadísticos y regresión de Cox.

Se desarrolló una puntuación MSI-H basada en el aprendizaje automático, utilizando clasificadores de impulso de gradiente extremo apilados, para cuantificar la similitud de los datos del paciente con los datos de MSI-H, basándose en la distribución de las células inmunitarias, las características clínicas y las mutaciones genéticas. El modelo fue robusto y pudo abordar la falta de datos de entrada para la distribución de las células inmunitarias y las mutaciones genéticas. El sistema de puntuación funcionó bien (coeficiente de Cohen medio de 0,40, DE 0,05, en más de 10 semillas aleatorias) en la identificación de muestras MSS similares a MSI-H con distribuciones de TIL similares a los CCR MSI-H genuinos. No se observó ninguna diferencia significativa entre las características de los TIL de los CCR MSS similares a MSI-H y los CCR MSI-H.

La diferencia entre los CCR MSS similares a MSI-H y los CCR MSS podría residir en las poblaciones de células T reguladoras (p = 0,09) y macrófagos (p = 0,16) dentro de la región del estroma tumoral. Algunos pacientes con CCR MSS presentaron distribuciones de células inmunitarias similares con alta inmunoactividad en comparación con los pacientes con CCR MSI-H. La puntuación MSI-H sirve como una métrica para cuantificar la similitud de los CCR MSS con los CCR MSI-H y presenta una vía prometedora para un tratamiento de inmunoterapia contra el cáncer más personalizado y eficaz, ofreciendo una referencia clínica para posibles dianas de ICIs en los CCR MSS.