El modelo de riesgo de los genes relacionados con la separación por fase líquido-líquido revela el pronóstico y las características del microambiente tumoral del cáncer colorrectal.

El progreso del cáncer colorrectal (CRC) implica la separación de fase líquido-líquido (LLPS), pero su significancia pronóstica permanece sin explorar. Utilizando los datos transcriptómicos del Proyecto Genoma del Cáncer Atlas, desarrollamos un modelo de riesgo basado en LLPS que superó a los métodos tradicionales de agrupamiento. Los pacientes de alto riesgo presentaron peores resultados, correlacionando con una mayor carga mutacional tumoral y reducción en la infiltración de células NK/T, pero aumento en la respuesta predicha al bloqueo del punto de control inmune. El análisis de sensibilidad a los fármacos sugirió eficacia terapéutica de Entinostat y 5-fluorouracilo en este subgrupo.

Se identificaron cinco genes pivote (ASXL1, DDX21, HNRNPA1L2, TACC3 y TRIM28) como reguladores LLPS-dirigidos del progreso del CRC, vinculando mecanísticamente la separación de fase a la desregulación epigenética, el recorte inadecuado del ARN y la reprogramación metabólica.

Nuestro estudio proporciona el primer marco pronóstico asociado con LLPS para el CRC, ofreciendo tanto una herramienta de estratificación de riesgo como insights terapéuticos accionables. Los hallazgos destacan a LLPS como un organizador molecular crítico en la patogenia del CRC y potencial objetivo para las aproximaciones de oncología precisa.