Implicaciones clínicas de la secuenciación del genoma completo en el cáncer colorrectal metastásico.

La secuenciación del genoma completo (WGS) proporciona información genética completa en una sola prueba, lo que respalda la transición hacia un tratamiento individualizado del cáncer colorrectal metastásico (mCRC). Aunque la WGS está validada como prueba diagnóstica, sus posibles implicaciones clínicas para el mCRC siguen siendo desconocidas. Evaluamos las consecuencias clínicas de la WGS en 96 pacientes con mCRC. Los biomarcadores clínicamente relevantes fueron identificados por un biólogo molecular y un oncólogo médico, y se definió el valor añadido como aquellos biomarcadores que no se detectan mediante los métodos diagnósticos estándar.

Evaluamos cómo estos biomarcadores influyeron en las decisiones de tratamiento. Utilizamos organoides derivados del paciente (PDO) para evaluar la sensibilidad a los fármacos, probando inhibidores de MET, MEK y CDK4/6, y traducimos los hallazgos genómicos en evidencia funcional. La WGS proporciona biomarcadores con implicaciones clínicas en el 81% de los pacientes, y el 49% (N = 47/96) fueron identificados mediante WGS y no fueron detectados por los métodos diagnósticos basados en las guías clínicas, y el 40% (N = 38/96) no fueron detectados por los métodos diagnósticos aplicados. La proporción de pacientes que reciben un tratamiento basado en biomarcadores ha aumentado del 11% a al menos el 24% mediante la WGS.

Los PDO con biomarcadores relevantes mostraron una respuesta diferencial clara a los diferentes tratamientos basados en biomarcadores. La WGS permite intervenciones terapéuticas considerablemente más personalizadas y representa un enfoque prometedor para avanzar en la oncología de precisión para pacientes con mCRC. El preselección de tratamientos con PDO puede refinar la terapia al identificar tratamientos (in)eficaces en un contexto específico del paciente, con el fin de acelerar el desarrollo de tratamientos personalizados.