La resistencia a los medicamentos sigue siendo un desafío clínico importante en el tratamiento del cáncer colorrectal (CRC) con regímenes de quimioterapia convencionales. Analizar los cambios post-tratamiento en las células tumorales y en el microambiente tumoral (TME) es esencial para comprender el desarrollo de la resistencia. Analizamos datos de secuenciación del RNA a nivel individual (scRNA-seq) derivados de 50 cánceres colorrectales (CRCs). Esta cohorte incluyó 30 tumores naïve al tratamiento (25 microsatélite estable (MSS) y cinco microsatélite inestable (MSI)) y 20 tumores que habían recibido quimioterapia estándar previamente (comprendiendo 14 respondientes y 6 progresivos).
En comparación con los tumores MSS, los tumores MSI exhibieron un microambiente tumoral (TME) enriquecido en inmunidad, marcado por una mayor actividad de células T citotóxicas y una fenotipo mesénquima menos pronunciado. Los CRC primarios del lado izquierdo estuvieron asociados con potencial metastásico y linfocitos B agotados. En el CRC post-tratamiento, los respondientes mostraron una alta prevalencia de la firma TME de células dendríticas (DC), lo que se correlacionó con mejor supervivencia en TCGA. Los progresivos mostraron un enriquecimiento del TME de fibroblastos pericitoides (asociados con mala supervivencia) y células T CD8 agotadas, sugiriendo un TME proinflamatorio.
Las células tumorales de los progresivos también expresaron dos marcadores de protección quimioterapéutica, MTRNR2L1 y CDX1, coexpresados con el punto de control inmunitario relacionado a la estaminalidad CD24.
En resumen, scRNA-seq revela marcadores y características pronósticas distintas subyacentes al progreso hacia la quimioterapia en CRC MSS.
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