Análisis espacio-temporal multiescala de datos de investigación.

MuSTARD es un proyecto singular en el sentido de que los investigadores desarrollarán un marco computacional concebido como una solución común para diversas aplicaciones. Este marco responde a una necesidad común: la derivación de modelos espacio-temporales (ST) multiescala equipados con capacidades de inferencia estadística. Desde la secuenciación del genoma humano, una parte importante de la investigación clínica se ha centrado en el estudio de la medicina de precisión (PM), lo que ha dado lugar a numerosos avances tanto en enfermedades no transmisibles como infecciosas. La PM se refiere al tratamiento y la prevención de enfermedades que tienen en cuenta la variabilidad en los genes, el entorno y el estilo de vida de cada persona. Los principales impulsores de la PM son las tecnologías ómicas. Los datos ómicos se obtienen de nuevos instrumentos de alto rendimiento que generan grandes volúmenes de datos. También son datos notoriamente complejos de analizar. En los últimos años, una nueva tecnología de separación nos ha permitido medir los datos ómicos a nivel de célula individual, creando un nuevo (y aún más complejo) tipo de datos al que generalmente se denomina ómica unicelular. Esto nos permite estudiar la distribución espacial de los datos ómicos en una muestra. La ómica espacial y unicelular representa una de las estrategias más potentes en la actualidad para comprender la propagación del cáncer en el tiempo y el espacio. Ómica espacial. Desafortunadamente, no existen herramientas computacionales que puedan combinar fácilmente la naturaleza de este nuevo tipo de datos con una potente inferencia estadística. Además, los experimentos de ómica espacial con mediciones repetidas son otra forma de datos espacio-temporales complejos. MuSTARD proporcionará un nuevo marco computacional que pueda manejar los datos ómicos espacio-temporales para comprender la propagación del cáncer colorrectal en el tiempo y el espacio, y aprovecharlo en un nuevo estudio clínico con un tamaño de muestra reducido (15 pacientes). El marco computacional MuSTARD aplicado a la ómica espacio-temporal estará disponible para la comunidad en general en forma de software de código abierto.