Mecanismos de recurrencia del adenoma colorrectal tras la resección y un protocolo de investigación multi-ómica.

Nuestro objetivo es establecer un atlas de células individuales de adenomas primarios, adenomas recurrentes y mucosa normal emparejada, identificar subpoblaciones celulares y vías transcripcionales asociadas a la recurrencia, y construir un modelo de predicción de riesgo de recurrencia (integrando características multiómicas y variables clínicas). En última instancia, proponemos un panel de biomarcadores que puedan utilizarse para optimizar las estrategias de seguimiento y guiar posibles intervenciones basadas en el microbioma.

Partiendo de la premisa de cumplir con los requisitos clínico-patológicos habituales, recopilaremos muestras de tejido de 30 pacientes con adenomas colorrectales. Cada muestra de adenoma recogida se dividirá en tres porciones iguales para el secuenciamiento de ARN de células individuales (scRNA-seq), el secuenciamiento de ATAC de células individuales (scATAC-seq) y el secuenciamiento de la diversidad del microbioma, respectivamente. Dos años después de la toma de muestras, los pacientes incluidos se someterán a una colonoscopia de seguimiento. Aquellos en los que se detecten adenomas se clasificarán como el grupo de recurrencia, mientras que aquellos sin adenomas se clasificarán como el grupo de no recurrencia. Los datos de secuenciamiento se analizarán conjuntamente junto con los registros médicos clínicos. Las muestras de tejido obtenidas no afectarán al diagnóstico de rutina ni a los resultados del tratamiento.