KRAS es uno de los genes más frecuentemente mutados en el cáncer colorrectal (CRC) y desempeña un papel crucial en la tumorigénesis, progresión, evasión inmunitaria y resistencia al tratamiento. La heterogeneidad pronunciada dentro del CRC mutante KRAS resalta la necesidad urgente de abordajes terapéuticos más precisos y personalizados. Para investigar esta heterogeneidad, empleamos secuenciación de RNA a nivel de célula única y transcriptómica espacial para caracterizar exhaustivamente el microambiente tumoral del CRC mutante KRAS. El preprocesamiento de datos y la agrupación se realizaron utilizando Scanpy.
La desconvolución de tipo celular espacial se llevó a cabo mediante Cell2location, mientras que la comunicación intercelular y las dependencias espaciales fueron analizadas usando CellChat, MISTy y stLearn. Nuestros análisis revelaron que las células epiteliales tumorales mutantes KRAS reclutan monocitos Mono_S100A8 a través del eje de señalización MDK_SDC4. Concurrentemente, los fibroblastos Fib_CTHRC1 circundantes secretan colágeno, el cual interactúa con receptores integrina en células epiteliales mutantes KRAS y contribuye a la exclusión de la infiltración linfocitaria. Estos componentes celulares colaborativamente establecieron un nicho espacial inmunosupresor.
Estos hallazgos ofrecen nuevas perspectivas teóricas e implican posibles objetivos para el desarrollo de estrategias reguladoras inmunitarias adaptadas al CRC mutante KRAS.
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