[Análisis de los resultados discordantes entre la PCR de fluorescencia múltiple por electroforesis capilar para la detección de la inestabilidad de microsatélites (MSI) y la inmunohistoquímica (IHQ) para la expresión de las proteínas de reparación del desajuste (MMR) en el adenocarcinoma gastrointestinal].

Objetivo: Este estudio investigó las causas subyacentes de la discordancia entre la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) multiplexa con electroforesis capilar para determinar el MSI y la inmunohistoquímica (IHC) para la evaluación de las proteínas de reparación del desajuste (MMR) en los adenocarcinomas gastrointestinales, con el objetivo de mejorar la precisión de la interpretación y guiar las estrategias de tratamiento clínico de precisión. Métodos: Se realizó un análisis retrospectivo de 511 muestras quirúrgicas resecadas o biopsiadas (161 adenocarcinomas gástricos y 350 adenocarcinomas colorrectales) diagnosticadas en el Departamento de Patología del Hospital Ruijin, afiliado a la Facultad de Medicina de la Universidad de Shanghái Jiao Tong, desde enero hasta junio de 2024. La expresión de las proteínas MMR de los tumores se evaluó mediante IHC, mientras que el estado de MSI se evaluó utilizando el Panel 2B3D del Instituto Nacional del Cáncer (NCI) mediante PCR multiplexa con electroforesis capilar en el ADN tumoral y el ADN normal correspondiente. Se analizó la concordancia entre los dos métodos y se investigaron los factores que contribuyen a la discordancia.

Los casos con loci dinucleotídicos inestables solo en el Panel 2B3D del NCI, pérdida focal de proteínas MMR o discrepancias inexplicables se validaron utilizando el Panel no NCI mediante marcadores de PCR multiplexa con electroforesis capilar o secuenciación de nueva generación (NGS). Resultados: En los 511 adenocarcinomas gastrointestinales, los resultados de los dos métodos fueron discordantes en 15 casos (2,9%), con una tasa de discordancia significativamente mayor en los cánceres gástricos (7,5%, 12/161) en comparación con los cánceres colorrectales (0,9%, 3/350; P < 0,001). Los principales factores que contribuyeron a la discordancia incluyeron: limitaciones en el muestreo (6 casos), limitaciones en el diseño del Panel 2B3D del NCI (3 casos), heterogeneidad tumoral (3 casos), deficiencia aislada de MSH6 (1 caso) y discrepancias inexplicables (2 casos). Los estudios de validación demostraron que los casos con inestabilidad solo en dinucleótidos mostraron concordancia con la IHC después de utilizar el Panel no NCI mediante PCR multiplexa con electroforesis capilar y verificaciones de NGS. Las muestras con pérdida focal de proteínas MMR y discrepancias inexplicables se alinearon con los resultados iniciales de la PCR tras la validación por NGS.

Los casos inexplicables presentaban variantes del gen Kirsten rat sarcoma y múltiples alteraciones genéticas. Conclusiones: El adenocarcinoma colorrectal demostró una mayor concordancia entre la PCR con electroforesis capilar y la IHC que el adenocarcinoma gástrico.

Los resultados discordantes requieren una evaluación sistemática que incluya una revisión técnica, un control de calidad de las muestras y un análisis complementario de NGS para resolver las discrepancias. PCR - MSI - IHC - MMR - MSI MMR - 2024 1-6 - 511 - 161 - 350 - IHC - MMR - 2B3D - NCI Panel - PCR - DNA - DNA - MSI - MMR - NCI Panel - PCR - NGS - 511 - 15 - 2,9% - PCR - IHC - 7,5% - 12/161 - 0,9% - 3/350 - P < 0,001 - PCR - IHC - 1 - 6 - 2 - 2B3D - NCI Panel - 3 - 3 - 3 - 4 - MSH6 - 1 - 5 - 2 - 3 - NCI Panel - PCR - NGS - IHC - MMR - 3 - 2 - NGS - 2B3D - NCI Panel - PCR - NGS - PCR - IHC - NGS.