Los cánceres del sistema digestivo (DSC) siguen siendo algunos de los cánceres más prevalentes y letales en todo el mundo, representando más de una cuarta parte de los diagnósticos de cáncer y un tercio de las muertes por cáncer. Los avances en la secuenciación de nueva generación (NGS) han acelerado el descubrimiento de alteraciones genéticas, epigenéticas y transcripcionales, pero aún falta una visión general integrada en todos los DSC. Esta revisión exploratoria sintetizó 57 estudios publicados entre 2013 y 2025 en PubMed, Scopus y Web of Science. Los cánceres colorrectales y gástricos fueron los más representados, mientras que los cánceres esofágicos, pancreáticos y los subtipos poco frecuentes, como los cánceres de vesícula biliar y de las vías biliares, fueron poco estudiados.
Se identificaron alteraciones recurrentes en TP53, KRAS, PIK3CA y CDKN2A, junto con la deficiencia en la reparación de errores de emparejamiento y la inestabilidad de microsatélites en los cánceres colorrectales y gástricos. La evidencia emergente de estudios publicados recientemente destaca aún más la contribución de las alteraciones germinales y el aumento de la heterogeneidad molecular en subtipos seleccionados de DSC. La desregulación epigenética y las aplicaciones recientes de la transcriptómica unicelular y espacial resaltaron la heterogeneidad tumoral. A pesar de los avances, la evidencia sigue siendo desigual entre los diferentes tipos de cáncer, con una exploración limitada de las variantes germinales más allá de los cánceres colorrectales, pancreáticos y algunos cánceres de hígado.
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