SPP1 como posible marcador específico de la etapa del cáncer colorrectal.

Antecedentes: El cáncer colorrectal es el tercer cáncer más diagnosticado y una de las principales causas de muerte relacionada con el cáncer en todo el mundo. La detección temprana mejora significativamente los resultados en los pacientes, pero muchos casos se identifican solo en etapas avanzadas. La alta heterogeneidad molecular y genética del cáncer colorrectal presenta importantes desafíos en el diagnóstico preciso, el pronóstico y la estratificación terapéutica.

Los avances recientes en el perfilado de la expresión génica ofrecen nuevas oportunidades para descubrir genes que desempeñan un papel en la carcinogénesis del cáncer colorrectal y que pueden contribuir al diagnóstico temprano, la predicción del pronóstico y la identificación de nuevas dianas terapéuticas. Métodos: Este estudio involucró 142 muestras: 84 muestras de tumores primarios, 27 metástasis hepáticas y 31 tejidos adyacentes no tumorales que sirvieron como controles. Se realizó secuenciación de ARN en un subconjunto de tejidos (12 metástasis hepáticas y 3 tejidos adyacentes no tumorales) utilizando un panel de ARN dirigido que abarca 395 genes relacionados con el cáncer. El procesamiento de datos y el análisis de expresión génica diferencial se llevaron a cabo utilizando las herramientas DRAGEN RNA y DRAGEN Differential Expression. La expresión de seis genes involucrados en las vías de hipoxia y transición epitelio-mesenquimal (EMT) (SLC16A3, ANXA2, P4HA1, SPP1, KRT19 y LGALS3) que se identificaron como genes con expresión significativamente diferente se validó en toda la cohorte mediante PCR cuantitativa en tiempo real.

Los niveles de expresión relativos se determinaron utilizando el método ?ct y log2FC, y se compararon entre diferentes grupos según el tipo de muestra, los parámetros clínicos y el estado mutacional de los genes KRAS, PIK3CA, APC, SMAD4 y TP53. Resultados: Nuestros resultados sugieren que la expresión de todos los genes validados se altera significativamente en las metástasis en comparación con las muestras de control no tumorales (p < 0,05). El cambio más pronunciado se produjo en los genes P4HA1 y SPP1, cuya expresión aumentó significativamente en las metástasis en comparación con las muestras no tumorales y de tumores primarios, así como entre las etapas clínicas del cáncer colorrectal (p < 0,001).

Además, todos los genes, excepto LGALS3, mostraron una expresión significativamente alterada entre las muestras no tumorales y las muestras en la etapa I de la enfermedad, lo que sugiere que desempeñan un papel en las etapas tempranas de la carcinogénesis (p < 0,05).

Además, los resultados sugieren que el estado mutacional del gen KRAS no afectó significativamente la expresión de ninguno de los genes validados, lo que indica que estos genes no están involucrados en la carcinogénesis del cáncer colorrectal con mutación de KRAS. Conclusiones: Con base en nuestros resultados, los genes P4HA1 y SPP1 parecen desempeñar un papel en la progresión y metástasis del cáncer colorrectal y son genes candidatos para una mayor investigación como posibles biomarcadores en el cáncer colorrectal.