La metástasis linfática es un factor pronóstico crítico en el cáncer colorrectal (CRC). Identificar genes clave asociados con la metástasis puede mejorar la estratificación del riesgo y las estrategias de tratamiento.
Este estudio tuvo como objetivo identificar una firma génica relacionada con la metástasis linfática e investigar el papel del NPR3. Analizamos el conjunto de datos GSE87821 para identificar genes diferencialmente expresados en tejidos CRC con y sin metástasis linfática. Se construyó una firma génica relacionada con la metástasis linfática (LNMRGS) utilizando regresión por operador de selección y contracción mínima absoluta (LASSO). Se analizó la correlación entre LNMRGS e indicadores clínicos, microambiente inmune y vías de señalización.
El papel del NPR3 se investigó más a fondo mediante experimentos in vitro e in vivo. Identificamos 110 genes upregulados y 58 downregulados en tejidos CRC con metástasis linfática. La LNMRGS, compuesta por Integrina Subunidad Beta 3 (ITGB3), IQ Motif Conteniendo Dominio AAA 1 (IQCA1), Angiopoietina-Like 4 (ANGPTL4) y Natriurético Peptido Receptor 3 (NPR3), predijo la supervivencia global en varios conjuntos de datos. Una alta LNMRGS estuvo asociada con sexo femenino, recurrencia tumoral, metástasis linfática, metástasis distante y mutaciones KRAS.
El knockdown del NPR3 inhibió la proliferación, migración e invasión de células CRC in vitro e in vivo, y redujo la quimoresistencia a 5-fluorouracilo (5-FU) y oxaliplatino. La LNMRGS es una firma pronóstica robusta para el CRC. El NPR3 juega un papel clave en la progresión metastásica y la quimoresistencia, sugiriendo que podría ser un objetivo terapéutico potencial.
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