PITCHER (Heterogeneidad de la carcinomatosis peritoneal)

Cómo la desregulación epigenética afecta a los patrones de expresión génica en subclones del mismo tumor es algo poco conocido. La carcinomatosis peritoneal (CP) es una condición en la que se desarrollan múltiples metástasis del mismo tumor abdominal en la cavidad peritoneal y en los órganos intraperitoneales, definiendo así diferentes ecosistemas del mismo cáncer. PITCHER aborda las variaciones en la expresión génica regulada epigenéticamente entre diferentes subclones de CP en relación con las respuestas mecanotransduccionales de las células, proporcionando información sobre cómo evolucionan los paisajes epigenéticos del cáncer bajo presiones ambientales y sobre las estrategias utilizadas por las células cancerosas para adaptarse a la transición de un ecosistema a otro.

PITCHER es una red de 10 equipos de Lyon, Grenoble y Marsella, basada en la recopilación de datos y muestras de pacientes que se han sometido a una cirugía para tratar una carcinomatosis peritoneal de origen ovárico o colorrectal. Se recogerán lesiones de CP y, en su caso, muestras correspondientes de tumores primarios en los mismos pacientes en el momento de la cirugía o, en su caso, se obtendrán de muestras ya existentes. Los paisajes epigenéticos se analizarán mediante un proceso bioinformático que combina el secuenciamiento del exoma, el transcriptoma y el metiloma para identificar "puntos críticos epigenéticos", y se evaluarán sus variaciones entre las lesiones. Estos análisis se realizarán en muestras frescas (cuando estén disponibles) o preexistentes. Cuando sea posible, se derivarán cultivos de organoides y modelos animales a partir de estructuras multicelulares en fluidos peritoneales y membrana, y se caracterizarán las respuestas mecanotransduccionales del citoesqueleto y el nucleoesqueleto utilizando la microscopía de fuerza atómica. Se abordará el papel de la axonogénesis tumoral, un proceso de neoformación de fibras axonales en los tumores. Se realizarán estudios experimentales de las respuestas celulares a la terapia para derivar modelos predictivos matemáticos. Todos los componentes se integrarán en un mapa de biología de sistemas de la CP.