La heterogeneidad intratumoral (ITH) de las lesiones precancerosas del cáncer colorrectal es un área de investigación importante para comprender la diversa biología del cáncer colorrectal (CRC). La evaluación precisa de la ITH depende en gran medida de la estrategia de muestreo utilizada. Presentamos un nuevo enfoque metodológico denominado topografía de la heterogeneidad tumoral completa (WTHT) y lo comparamos con tres estrategias de muestreo descritas anteriormente: homogeneización del tumor completo, macrodisección de regiones tumorales seleccionadas y muestreo múltiple. Se procesó una cohorte de 184 lesiones precancerosas avanzadas del cáncer colorrectal en bloques de parafina, y toda la masa tumoral se dividió sistemáticamente en muestras de tamaño igual (~10 mm3).
Se aisló el ADN de cada muestra por separado y se analizó para detectar mutaciones en puntos críticos en APC, KRAS, BRAF, PIK3CA y TP53. La ITH se cuantificó utilizando la varianza de la mutación y un nuevo índice de heterogeneidad (HG).
Los resultados obtenidos mediante WTHT se compararon estadística y gráficamente con tres estrategias de muestreo modeladas. Se observaron diferencias significativas entre los enfoques de muestreo analizados. La macrodisección mostró la mayor desviación de WTHT, lo que indica un sesgo de muestreo sustancial, mientras que el muestreo múltiple produjo los resultados más cercanos. WTHT permitió la cuantificación precisa y el mapeo espacial de los clones mutacionales en toda la lesión.
WTHT combinado con HG proporciona un marco robusto y reproducible para la evaluación integral de la ITH en adenomas colorrectales.
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