Una clasificación sólida basada en inmunohistoquímica para el cáncer colorrectal con mutación BRAF V600E y sus implicaciones clínicas.

El cáncer colorrectal (CCR) con mutación BRAF V600E representa un subtipo molecular distinto con una considerable heterogeneidad en la biología tumoral y la respuesta terapéutica. Aunque las clasificaciones basadas en la expresión génica (subtipos BM1/BM2) proporcionan información valiosa sobre las características moleculares e inmunitarias subyacentes, su aplicación clínica se ve limitada por la necesidad de secuenciación de alto rendimiento. El objetivo de este estudio es establecer un sistema de clasificación basado en inmunohistoquímica (IHQ) para permitir una estratificación práctica de subtipos y facilitar la evaluación pronóstica y terapéutica. Utilizando dos cohortes independientes (conjunto de datos público, n = 218; cohorte institucional, n = 122), realizamos análisis de expresión diferencial, modelado de aprendizaje automático y evaluación de viabilidad clínica.

Se identificaron catorce marcadores candidatos, y un algoritmo de árbol de decisión seleccionó CD8 y ARHGEF17 como los clasificadores óptimos. Basándose en estos marcadores, se establecieron dos subtipos basados en IHQ: iBM1 (CD8+/ARHGEF17-) e iBM2 (CD8- con cualquier expresión de ARHGEF17 o CD8+/ARHGEF17+). Los subtipos basados en IHQ mostraron concordancia con los subtipos BM transcriptómicos (entrenamiento: 82,69 %, ? = 0,55; validación: 72,22 %, ? = 0,44; prospectivo: 83,33 %, ? = 0,57). El perfilado transcriptómico reveló un enriquecimiento de la activación inmune y la transición epitelio-mesenquimal en iBM1, y vías relacionadas con el ciclo celular en iBM2.

En la validación clínica, iBM1 se asoció con una peor supervivencia, pero con una mayor sensibilidad a los inhibidores de los puntos de control inmunitario. Esta clasificación basada en IHQ proporciona un enfoque práctico y accesible para la estratificación de subtipos BM, que refleja las características moleculares e inmunitarias subyacentes, y puede respaldar la evaluación pronóstica y la toma de decisiones terapéuticas en el CCR con mutación BRAF V600E.