Las mutaciones de KRAS y BRAF son conductores oncogénicos críticos en el cáncer colorrectal (CRC), con implicaciones moleculares y clínicas distintas. Para descubrir genes diferencialmente expresados entre estas mutaciones, comparamos líneas celulares CRC mutadas por KRAS G12D y BRAF V600E. Se realizó la construcción de redes de interacción proteínica (PPI), el enriquecimiento de vías, el análisis de supervivencia y la búsqueda de blancos para fármacos con el fin de identificar oportunidades terapéuticas. Se identificaron diez genes centrales-TNF, IL1B, FN1, EGF, IFI44L, EPSTI1, AHR, COL20A1, CDH1 y SOX9-como críticos en el CRC impulsado por KRAS.
El análisis de enriquecimiento destacó vías inmunes e inflamatorias, incluyendo "SARS-CoV-2 Signaling" y "Macrophage Stimulating Protein Signaling", así como procesos celulares como "Positive Regulation of PI3K Signaling". IL1B fue el único gene central significativamente asociado con la supervivencia global, sugiriendo su papel como marcador pronóstico favorable. La búsqueda de fármacos identificó inhibidores selectivos como Canakinumab y Rilonacept que se dirigen a IL1B, con estudios de acoplamiento revelando la interacción más fuerte para Omeprazole con AHR, seguido por Tapinarof con AHR y Donepezil con IL1B.
Este estudio arroja luz sobre las mecanismos moleculares del CRC mutado por KRAS, enfatizando a IL1B como marcador pronóstico. Entre los agentes terapéuticos identificados, Omeprazole demostró la interacción más fuerte con AHR, sugiriendo un potencial para reutilización en el tratamiento del CRC, mientras que inhibidores dirigidos a IL1B como Canakinumab emergieron como candidatos selectivos para modular la inflamación promotora de tumores. Nuevos genes como EPSTI1, COL20A1, CDH1 y SOX9 merecen una investigación adicional.
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